Это песочные часы с песком, перетекающим из верхней стеклянной бутылки в нижнюю часть отверстия. «Песочные часы, по которым течет песок» означает, что время идет. Следовательно, это выражение может не только использоваться для обозначения песочных часов, но также может означать, что время идет.
